一、孙尚香（赵薇饰）女扮男装混入曹营当细作，因帮助魏军蹴鞠高手孙叔财（佟大为饰）踢进关键球，两人很快有了亲密关系（有同性恋倾向）。在孙叔财的帮助下，孙尚香成功侦查绘制出曹营军事地图，将之当作内衣裹在身上，顺利逃回东吴军营，为孙刘联军破曹立下汗马功劳。赤壁大战中，两人在战场上重逢，孙叔财见到孙尚香喜出望外，不慎被东吴军队乱箭射死。枪林箭雨中，孙尚香视魏军如草芥，抱着孙叔财尸身痛声大哭良久。片尾，两军将士尸横遍野，孙尚香福大命大，安然无恙地抱着孙叔财抹眼泪……
这一段情节毫无道理，漏洞百出，把大战当儿戏，把观众当傻子，实在不明白编剧设计它的用意何在。哪怕是在商业娱乐片中，这样的情节也是弱智的。首先，孙尚香贵为孙权的妹妹，周瑜和诸葛亮怎可能让她冒险深入曹营刺探军情？一旦被曹军擒获当作人质，东吴方面岂不被动？其次，孙尚香是女人，就算是热爱刀戈剑戟的女强人，囿于自身生理条件，去男人成堆的曹营里当细作也没有任何优势。怎么可能如此轻松地混进曹营，还能成功侦查军情，绘制出地图？最后居然还能把地图当内衣裹在身上携带过江？第三，孙尚香撒娇让孙叔财带她“骑高高”，借机登高望远观察曹营情况，在孙叔财头上明目张胆地绘制地图。如果说导演和编剧这是在搞笑，想故意制造轻松气氛，那真是把观众当傻子，把大战当儿戏。说到傻子，佟大为扮演的孙叔财实在是不折不扣的傻子和白痴。除了踢得一脚好蹴鞠，在别的方面尤其是男女感情方面是典型的零智商。
二、孙刘联军误中曹操的瘟疫之计，军营内疫情蔓延，孙权和周瑜为此忧心忡忡。关键时刻，刘备背弃盟约，率军分道扬镳，想把硬仗推给孙权来打。而刘军既不想打，也没见他们投降，不知道想干嘛。
虽然后来知道这是周瑜用来迷惑曹操的计策，但是这个计策实在立不住脚，无法自圆其说。因为，就算抛开历史不说，《赤壁（上）》中刘备是因为被曹操军队追得走投无路，不得不派诸葛亮附东吴寻求结盟的，不结盟抗曹刘军只有死路一条，这是地球人都知道的道理。孙权还有可能背弃盟约，刘备那点实力连背弃盟约的资格都没有。如此低劣的计策？曹操怎么可能会相信？
三、小乔以有孕之身孤身前往曹营，对曹操施用“美人计”，拖延了曹军进攻的时间，等到了风向转变的时候，为孙刘联军取得赤壁之战的胜利赢得了战机。
看来吴宇森导演真是一个女权主义者。《赤壁（下）》中孙尚香和小乔两个女人起到了居功至伟的作用。可是，前面孙尚香卧底曹营已经漏洞百出，完全说不通，小乔的“美人计”虽然表面上看有点逻辑，但依然不可理喻。其一，两军江上对峙，守卫何等严密，就算小乔打算瞒着周瑜偷渡过江冒险立奇功，东吴军队怎么可能私自给有身孕的大都督夫人放行。除非是周瑜命令他们放行的，可影片中明明是周瑜看到小乔的留言才知道此事的。其二，曹操再笨，再贪图美色，也知道战机的重要性，怎么可能糊涂到在全军将士都等着他下令进攻之际，心安理得地和小乔品茶？
四、影片结尾，曹操被孙权、周瑜、刘备、关羽、张飞等人团团围住，观众都等着他束手就擒，以为吴宇森要改写历史之际。周瑜轻描淡写来了一句“你从哪里来还是回哪里去吧！”，就这么轻易把曹操放了！
《三国演义》里关羽华容道义释曹操的桥段没有了，我不怪导演和编剧，可是你们也不该让影片这么结尾啊。孙刘联军辛辛苦苦打了这么久，好不容易抓到曹军最高统帅，你周瑜说放就放了？你的主公孙权当时可就在身边，你怎么不征求一下他的意见？囚禁曹操或者杀掉曹操让北方重新陷入混乱局面，才是保证东吴自身安全的最好办法，周瑜怎么会糊涂到放虎归山？既然一开始就不打算尊重历史，编剧此时何不来得更彻底一点。如果这样，还不如设计成曹操凭自己努力逃出重围更合情合理一点。
